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返回 在基因測序風口之中搶占先機,上云是必由之路

2021-04-30

據相關機構的研究報告顯示,全球基因測序市場規模從2007年的800萬美元增長至2013年約45億美元,至2018年將達到約117億美元。其中,2007-2013年復合增長率為33.53%,預計2013-2023年復合增長率為21.06%,市場潛力巨大。

一時間,基因測序成為各國生物公司競爭的焦點,再加上我國政府于2015年“精準醫療”計劃的提出,使得基因測序逐漸成為我國科技醫療領域乃至各級政府備受關注的發展方向。

對于基因測序企業來說,生物技術的發展和基因測序經驗的積累自然是第一位,但是如何最優地獲得IT力量的加持,提升測序能力和數據分析能力,則成為加速基因測序事業發展的底層驅動力。

基因測序工程給IT系統帶來的巨大挑戰

一般人可能想象不到,基因測序工程動輒需要數萬/數十萬個基因測序及模型建立,需要多大的計算和存儲資源。以國內某機構每天產生的數據量300T至600T計算??梢哉f任何本地系統的擴容速度都無法追上這種規模的數據增長。用一句話來總結基因測序的實際情況就是:利用各種軟件進行各種運算,來處理海量的基因數據。

不管是直接購買物理機或者自建HPC集群,成本都是非常高的。在前期測序業務還沒有開展時,就需要投入大量資金進行設備采購維護,無疑提高了一個測序公司的風險成本。

其次,由于測序業務量本身是存在波動的,這會導致服務器的數量不能很好的控制。服務器不足則無法滿足業務高峰時的測序任務。如果采購可以滿足最大峰值的集群,那么在業務量不能時刻保持高峰時,就會存在很大的成本浪費。

有孚網絡助力基因企業構建核心IT能力

與前兩代技術相比,第三代測序技術最大的特點就是單分子測序,測序過程無需進行PCR擴增,超長讀長,以PacBioSMRT技術的測序讀長為例,平均達到10Kb-15Kb,是二代測序技術的100倍以上。但是這些優勢的達成,背后就必然要求企業的IT基礎能力提升一個大臺階,對網絡、存儲、算力及業務響應的及時性、可靠性、安全性等都提出了更高的要求。

基于基因測序企業對計算能力和海量存儲的需求,有孚網絡將兩種需求緊密結合,提供高密度的計算能力和高性能、高可靠、低時延、低成本的海量存儲系統,大幅降低成本,并根據需求調整規模和提高創新速度,幫助企業簡單便捷的管理大數據,真正做到為企業客戶降本增效。

具體來說,有孚網絡基于自有數據中心資源及有孚專有云部署的虛擬化存儲資源池,將藍光光盤、SATA、SAS、SSD等多種存儲介質靈活組合,可以滿足各種應用程序的多種需求,并根據數據的訪問頻率進行冷熱分層、自動沉降,以確保訪問性能并降低 TCO。

有孚網絡還可以打通從測序儀到云端存儲的數據傳輸通道,測序儀得到的基因組數據可以直接存儲在有孚云上,從而實現本地計算能力和云端計算能力的整合,利用云計算的彈性,迅速完成客戶的計算任務。讓企業可以將更多精力投入到業務能力上來,發揮數據的價值,為患者推薦更好的醫療方案。

海量數據從測序儀上下機之后,需要在不同地域、不同企業機構之間進行數據傳輸。這個時候的新問題就來了:基因數據相對比較隱私,公網傳輸安全措施不到位,防御能力很弱,數據安全難以保障,而且另外一方面數據傳輸效率也比較低。

如何將基因測序的海量數據安全、高效地進行傳輸?有孚網絡為企業客戶提供專網專線接入,包括但不限于電信、聯通、移動、教育、BGP等網絡服務,享受低延遲和高帶寬,保證海量基因數據的穩定傳輸;同時,與公網完全隔絕、無數據泄漏風險,實現高速、可靠和安全的數據傳輸。

隨著基因測序行業的發展,國家監管機構對相關數據的安全性要求會越來越高,而現有的數據存儲方式很難完全滿足數據安全等級保護的要求。

有孚網絡利用云平臺本身的vpc的網絡隔離,高防,數據加密等安全機制可以保證數據的安全性。當期客戶對業務部署的合規性或數據安全有較高要求時,采用物理隔離方式,確保資源獨享、數據隔離、可監管、可追溯。

隨著基因行業企業的不斷發展與擴大,IT硬件資源的運維在技術、建設周期和成本上都面臨巨大的挑戰。運維人員經常要去處理PB級別數據存儲包含規劃、分配、回收、歸檔等過程,這些過程對數據管理員要求非常高,造成運維壓力巨大。

而從現實的情況來看,基因行業的企業普遍缺少本地維護人員,很多公司沒有專門的運維人員。即便是有運維人員,運維的挑戰和成本也逐漸爬升,本地運維需要支出電費、人員成本、各種等保認證安全認證服務,還包括軟件的安裝&升級,故障的定位,環境的恢復等等,這些都無疑增大了運營成本。另外,產業園區內企業可能還會面臨來自園區的各種限制,比如場地不足、不能使用大功率設備等問題。

針對基因測序行業普遍缺少合規的服務器管理服務,缺乏服務器運維人員的現狀,有孚網絡依托自身在北京、上海、深圳的高等級云計算數據中心資源為基因行業提供合規的、安全的服務器托管與運維服務。

在基因測序領域,以數據分析、云計算為主導的IT技術已經成為驅動行業創新、變革的重要因素。云計算時代的到來,使數據以及計算全部可以在云上完成,滿足企業數據不下云、高效完成企業的計算需求,減少企業重資產投入以及運營維護的工作,讓客戶更聚焦在自身的業務發展上,有孚網絡將持續為推動基因測試行業的發展提供技術支持。

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